метод інтервалів
Величини pKa при цьому відіграють роль критичних точок функції, так як при відповідних значеніяхpH відбувається зміна заряду.
NB: В сильнокислой середовищі пріpH<2,5 формируется максимально возможный положительный заряд, в сильнощелочной, приpH> 12,5 пептид набуває максимально можливий негативний заряд.
Визначення заряду пептиду при всіх потенційно можливих значеніяхpH.
проаналізуйте пептид, відзначаючи структури, які можуть нести заряд (Табл. 1),
Відповідні величини pKa розташуйте на шкалі pH (від 0 до 14).
Відзначте інтервали і визначте величини зарядів пептиду в цих інтервалах,
Приклад - пентапептид глутаміл-аргініл-пролив-триптофану-цистеїн (Рис. 1).
Мал. 1. Визначення заряду пентапептіда на шкалі pH з використанням інтервального методу
Застосування: Відмінності в заряді пептидів використовується при поділі суміші пептидів методом електрофорезу, визначення напрямку і швидкості руху пептидів в електричному полі, оптимального значення рHбуфера для поділу суміші пептидів і т.д.). У перетравленні білків важлива роль градієнта рН соків різних відділів шлунково-кишкового тракту.
Розрахуйте інтервальним методом заряди наступних пентапептид: